El segundo equipo ha ascendido de forma brillante a la Primera División A
El equipo filial del Clipeus Nazareno nació en el año 1993 por la necesidad de contar con una cantera que aportara jugadores a la plantilla del primer equipo. Era un momento de crecimiento para el club, ya que el primer equipo ascendía a la categoría de Primera Nacional A, tras haber militado en temporadas pasadas en Provincial y Primera Nacional B. Posteriormente, llegaría a la División de Plata.
Desde su creación estuvo presente en competiciones locales y provinciales. Es a partir de la temporada 1998/99 cuando comienza a aportar jugadores a su primera plantilla, y sobre todo, a partir del salto de calidad que experimenta la entidad en la temporada 2004/2005, con la llegada a la presidencia de Juan Varela.
El equipo filial ha llegado a cotas altas en esta temporada pasada, ya que al comienzo de la misma la directiva apostó por este equipo e hizo las gestiones necesarias para que militara en la categoría de Primera Nacional B, tras el acuerdo de filialidad con el Carmona FS, y los fichajes para que el papel de este equipo fuera en esta nueva categoría lo más honroso posible.
Juego brillante
Para la temporada 2006/07 se ha recuperado a jugadores que estaban cedidos como Alberto y Jaime, se ha incorporado a Vicente como refuerzo proveniente del primer equipo. Se ficharon a otros jugadores como Miguel y Carlos (Utrera), Jesús (Sevilla) y Paco (Club Payasos de Bellavista). Ha sido una plantilla con calidad, experiencia y a la vez juventud, una de las más jóvenes de la categoría.
Comenzó la temporada con dos victorias consecutivas que los medios de comunicación declararon como sorprendentes por tratarse de dos de los equipos favoritos para el ascenso, lo que hace que la plantilla empezara a creer que ya estaban ascendidos al alcanzar la primera plaza en la clasificación. Nada más lejos de la realidad, ya que se bajó después hasta la novena plaza debido a lesiones, malas actuaciones arbítrales y llamada de algunos de los jugadores para el primer equipo. La siguiente victoria no llegó hasta la octava jornada.
Fue a partir de la octava jornada cuando el trabajo comenzó a dar sus frutos y cosecharon ocho jornadas consecutivas sin perder, en la jornada número quince se perdió contra el equipo que había quedado tercero en la tabla clasificatoria, y a partir de aquí los partidos se cuentan con victorias hasta la jornada veintitrés, en la que se volvió a perder ante el Villarrasa. Esa fue la última derrota del conjunto nazareno.
El juego de este equipo comenzaba a ser brillante y cada vez se jugaba con mayor intensidad en la liga.
El partido decisivo llegó cuando el equipo se enfrentó fuera de casa al Ciudad de Ceuta FS. Un feudo donde sólo ganaron los tres equipos primeros clasificados. Allí es donde se consiguió matemáticamente el ansiado ascenso del equipo filial del Clipeus FS Nazareno, a falta de una jornada para la finalización del campeonato.
Ha sido un hecho histórico para el club, ya que ahora tiene a su equipo filial en la categoría inmediatamente inferior a la que milita su primer equipo.
Era lo deseado por toda la junta directiva, pues con ello se consigue que los jugadores del filial compitan en una categoría muy similar a la del primer equipo.
Protagonistas
Han conformado el grupo Juan Miguel Martín Montavez, Lucas Romero Postigo, Vicente Lorente Navarro, José A. Sánchez Román, Mariano Atienza Chaparro, Javier Martín Jurado, Jaime Verdugo Román, Diego Ortiz Rodríguez , Alberto Palmero Murillo, Alexis Jiménez Martín, Jairo Carballido Sánchez, Juan Carlos Dianez Martín, Miguel Vázquez Muñoz, Francisco Javier Delgado Domínguez, Rafael Hidalgo Fernández y Jesús Callejo Maderuelo (abandonó por lesión). El entrenador es Jorge Prieto Baena, el delegado Hipólito Macías Pichardo y los auxiliares Juan Castro Cortés, Francisco J. Verdugo Román y César Gómez del Bosque.
